Российская подводная лодка специального назначения с ракетным вооружением таинственно исчезает без следа во время выполнения секретной операции в Гренландском море. Для её поисков направляется команда под руководством Виктора Воронина, чей старший брат был командиром пропавшего судна. Перед экипажем стоит цель — во что бы то ни стало обнаружить субмарину и предотвратить попадание новейшего секретного оружия в руки противника.
В это же время из-за геологических изысканий на полярной станции в северных водах пробуждается Кракен — огромное чудовище, умеющее сливаться с подводным мраком и обладающее незаурядным интеллектом. Именно с этим существом предстоит встретиться морякам, занятым поисками пропавшей подлодки.